Desde cedo, Imhotep foi celebrado por seu gênio multifacetado. Na arquitetura e engenharia, é tradicionalmente associado ao projeto da Pirâmide de Djoser, em Saqqara, considerada a primeira pirâmide do Egito e um marco revolucionário da construção monumental. A obra substituiu os antigos túmulos mastaba por uma estrutura escalonada em pedra, influenciando todas as pirâmides posteriores.
Na medicina, ficou conhecido como o primeiro médico da história com nome registrado. Tradições posteriores o apontam como fundador da medicina egípcia, atribuindo a ele métodos de diagnóstico, uso de ervas, procedimentos cirúrgicos e uma abordagem sistemática para o tratamento de doenças, chegando a diagnosticar centenas delas.
Como filósofo e sábio, foi associado à produção de textos de sabedoria e ao ensino moral. Mais tarde, passou a ser ligado ao deus Thoth, demonstrando sua reputação como guardião do conhecimento. Também teria explorado astrologia e ciências correlatas, integrando observações celestes à religião e ao calendário agrícola.